Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd160O88875 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd160O88875 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd160O88875 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd160O88875 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd160O88875 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd160O88875 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd160O88875 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd160O88875 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd160O88875 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd160O88875 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd160O88875 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd160O88875 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd160O88875 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd160O88875 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd160O88875 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd160O88875 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd160O88875 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd160O88875 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd160O88875 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd160O88875 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd160O88875 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd160O88875 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd160O88875 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd160O88875 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd160O88875 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd160O88875 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd160O88875 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd160O88875 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd160O88875 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd160O88875 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd160O88875 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd160O88875 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd160O88875 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd160O88875 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd160O88875 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd160O88875 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd160O88875 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd160O88875 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cd160O88875 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd160O88875 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cd160O88875 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd160O88875 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms