Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd200O54901 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd200O54901 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd200O54901 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd200O54901 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd200O54901 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd200O54901 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd200O54901 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200O54901 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms