Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek2O35942 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek2O35942 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek2O35942 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek2O35942 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nek2O35942 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek2O35942 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek2O35942 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek2O35942 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek2O35942 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek2O35942 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek2O35942 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms