Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dsg3O35902 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dsg3O35902 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg3O35902 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms