Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Xbp1O35426 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Xbp1O35426 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xbp1O35426 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms