Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebi3O35228 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebi3O35228 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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