Protein–RNA interactions for Protein: K7N724

Gm3453, Predicted gene 3453, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3453K7N724 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3453K7N724 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3453K7N724 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3453K7N724 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3453K7N724 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3453K7N724 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3453K7N724 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3453K7N724 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms