Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna9G3X8Z7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna9G3X8Z7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms