Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip11E9Q512 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip11E9Q512 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms