Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
8030474K03RikE9Q4Y8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms