Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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