Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rexo5D3YW29 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo5D3YW29 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo5D3YW29 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms