Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
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Rfx8D3YU81 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx8D3YU81 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Rfx8D3YU81 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Rfx8D3YU81 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Rfx8D3YU81 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Rfx8D3YU81 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Rfx8D3YU81 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rfx8D3YU81 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfx8D3YU81 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfx8D3YU81 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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