Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cspp1B2RX88 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cspp1B2RX88 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cspp1B2RX88 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms