Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp8b5A3FIN4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp8b5A3FIN4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms