Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Upf2A2AT37 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Upf2A2AT37 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Upf2A2AT37 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms