Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GabreA2AMW3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GabreA2AMW3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms