Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trav12-2A0N8N6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trav12-2A0N8N6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms