Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms