Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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