Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf19Q9JLL3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms