Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn5Q9JL35 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hmgn5Q9JL35 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Hmgn5Q9JL35 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms