Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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