Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms