Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snap29Q9ERB0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms