Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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