Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Swt1Q9DBQ9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms