Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms