Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms