Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Borcs6Q9D6W8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Borcs6Q9D6W8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Borcs6Q9D6W8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Borcs6Q9D6W8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Borcs6Q9D6W8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms