Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tubgcp4Q9D4F8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms