Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Trappc6bQ9D289 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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