Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C4

Trmt5, tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt5Q9D0C4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trmt5Q9D0C4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms