Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mis12Q9CY25 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms