Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Exo5Q9CXP9 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms