Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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