Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxxc1Q9CWW7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxxc1Q9CWW7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxxc1Q9CWW7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxxc1Q9CWW7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxxc1Q9CWW7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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