Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms