Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssxb1Q9CPU1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb1Q9CPU1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb1Q9CPU1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb1Q9CPU1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb1Q9CPU1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb1Q9CPU1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb1Q9CPU1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb1Q9CPU1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssxb1Q9CPU1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb1Q9CPU1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb1Q9CPU1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb1Q9CPU1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb1Q9CPU1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssxb1Q9CPU1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms