Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms