Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cep41Q99NF3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms