Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp1b4Q99ME6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms