Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms