Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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