Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Znf628Q8CJ78 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Znf628Q8CJ78 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms