Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Atg4aQ8C9S8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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