Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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