Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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