Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usp38Q8BW70 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usp38Q8BW70 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usp38Q8BW70 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usp38Q8BW70 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usp38Q8BW70 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp38Q8BW70 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp38Q8BW70 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp38Q8BW70 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp38Q8BW70 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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