Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdcl3Q8BVF2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Pdcl3Q8BVF2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Pdcl3Q8BVF2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Pdcl3Q8BVF2 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdcl3Q8BVF2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdcl3Q8BVF2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdcl3Q8BVF2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdcl3Q8BVF2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdcl3Q8BVF2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdcl3Q8BVF2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Pdcl3Q8BVF2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms